SELECT `seq` FROM sqlite_sequence WHERE `name` = 'TABLENAME';

上述を踏まえて以下のようにすることで取得できる。

    /**
     * auto_incrementで代入した最大値
     * @return
     */
    public long getLastInsertId() {
        long index = 0;
        SQLiteDatabase sdb = getReadableDatabase();
        Cursor cursor = sdb.query(
                "sqlite_sequence",
                new String[]{"seq"},
                "name = ?",
                new String[]{TABLENAME},
                null,
                null,
                null,
                null
        );
        if (cursor.moveToFirst()) {
            index = cursor.getLong(cursor.getColumnIndex("seq"));
        }
        cursor.close();
        return index;
    }